自1953年浙江省卫生防疫站成立至今，浙江省卫生防疫和疾病预防控制工作走过了60年历程。尤其在2000年浙江省疾病预防控制中心成立以来，浙江省的疾病预防控制事业迈入了快速、持续发展的阶段。
传染病、寄生虫病得到有效控制1953年基本消灭天花、鼠疫后，又成功消灭或基本消灭了钩虫病、姜片虫病、丝虫病、血吸虫病、疟疾；已有效控制了痢疾、霍乱、甲、乙型肝炎、伤寒和副伤寒、流行性乙型脑炎、麻风、狂犬病、流行性出血热等曾经严重威胁人民健康的传染病；实现了无脊髓灰质炎目标。20世纪50～60年代，全省甲乙类传染病年平均发病率高达2537.71/10万。而如今，我省的传染病发病率显著下降。从2004年实施传染病网络直报开始，全省甲乙类传染病报告发病率从407.34/10万下降到2012年的209.14/10万，下降了48.66%，达历史新低；传染病报告死亡率从0.57/10万下降到2012年的0.44/10万。
通过加强艾滋病综合监测，建立艾滋病筛查实验室网络，逐步推广艾滋病综合防治示范区，不断提高高危人群干预覆盖率，落实“四免一关怀”政策，将浙江省艾滋病疫情控制在低流行态势。
我省于90年代开始积极推行现代结核病控制DOTS策略，自2000 年开始，全面贯彻执行《浙江省结核病防治规划（2001—2010年）》。2012年全省新涂阳肺结核病人治愈率达90.13%，达到WHO和国家提出的防治目标，使全省结核病防治工作走在全国前列。
应急体系建设卓有成效省疾控中心于2008年建立了完善的应急处置组织体系，组建了一支能迅速处置传染性疾病疫情爆发、食源性疾病事件、职业中毒、生物化学恐怖事件、核辐射事件、自然灾害的应急队伍。对全省传染病疫情和突发公共卫生事件开展实时监测和24小时值班制度，为加强对聚集性发病、传染病明显频发等异常信号的搜索，每天开展人工预警。
儿童免疫规划持续推行通过计划免疫策略的实施，浙江省疫苗针对传染病取得了有效控制，目前维持无脊髓灰质炎状态，连续10多年无白喉病例报告，麻疹、百日咳、流脑、乙脑等疾病的发病率降至历史最低水平。全省国家免疫规划疫苗报告接种率达95%。
慢性病管理稳步推进近10年的监测结果显示：浙江省居民的期望寿命不断延长，2012年我省居民平均期望寿命为77.57岁，比2000年的74.88岁增加了2.69岁；传染病、孕产妇疾病、婴儿疾病所导致的死亡水平不断下降。但慢性病导致死亡的比例不断上升，已占人群总死亡的80%以上，仅恶性肿瘤、脑血管病、心脏病、糖尿病四项慢性病死亡人数就已占到全省居民因病死亡人数的60%以上，以高血压、糖尿病、恶性肿瘤等为主的慢性疾病呈快速上升趋势。为有效遏制慢性疾病上升趋势，我省不仅全面推动了全民健康生活方式行动，而且建立了在政府领导下，以患者为对象，以社区为平台，整合医院和专业防治机构的慢性病综合管理模式。开展慢性病监测，完善全省慢性病监测网络直报系统；推动高血压、糖尿病社区综合防治规范化发展，开展重点慢性病社区综合防制试点，实施规范推进项目，提升社区防制工作水平；积极开展国家级和省级慢性非传染性疾病综合防制示范区创建工作。截至目前，全省电子健康档案建档率达87.7%，管理高血压患者398.8万人，糖尿病患者94.2万人，全省完成农村妇女宫颈癌档检查累计达318.8万人次、乳腺癌检查累计达224.9万人次。全省慢性病防控工作取得成效。
健康教育和健康促进不断深化通过10多年的不懈努力，营造了全民关注健康，学习健康知识，掌握健康技能的良好氛围。据调查显示，我省人群基本卫生防病知识知晓率为87.80%，重点卫生防病知识知晓率为86.85%，提前达到浙江省卫生强省规划指标要求。
卫生监测、检验检测拓展创新我省疾病监测网络建设快速推进，国家传染病报告、突发公共卫生事件报告、健康危害因素监测等13套监测系统在我省全面应用。经过十多年的努力，一张覆盖全省的公共卫生监测网络基本建成，涵盖了传染病、健康危害因素、地方病、病媒生物、慢性病和健康教育等六大方面共433个工作点，覆盖全省所有县（市、区）。
省疾控中心拥有各类专用检测设备3431台，包括病毒载量检测系统、目标蛋白分析仪、荧光定量PCR仪、液相色谱质谱联用仪、气相色谱-质谱联用仪、全自动DNA测序仪等高精尖仪器设备。先后建立了SARS、人感染禽流感、手足口病、甲型流感H1N1等的核酸快速检测方法，使我省在上述领域处于全国领先地位；建立完善了浙江省食源性病原菌污染状况的基线值；研发了肠出血性大肠杆菌O157：H7、军团菌、霍乱弧菌、单增李氏菌等的LAMP检测方法；率先开展了二恶英和转基因食品检测；对苏丹红、三聚氰胺、抗生素、三氯丙醇、地沟油、塑化剂等有害物质的检测水平处于国内先进。
目前，省疾控中心通过认可认证的检验项目已达到1045项，具备了利用1470个标准对外出具检测结果的能力。
科学研究取得显著成效省疾控中心目前建有浙江省肾综合症出血热、公共卫生应急检测关键技术、食品安全（联建）等3个省级重点实验室；建有浙江省中医药食品功能学研究厅级重点实验室1个；建有1个公共卫生检验检测厅级重点学科群及3个厅级重点学科。2012年，“公共卫生监测及突发事件处置关键技术研究”创新团队获省委、省政府立项；申请成功了博士后流动工作站。中心研发的“三聚氰胺”快速检测技术、甲型H1N1流感快速诊断技术、禽流感PCR快速检测技术与地沟油检测技术在相关疾病防控中起到了重要的支撑作用。
据统计，自2000年以来，省疾控中心获得各类科技项目413项，其中国家级49项，省部级97项，厅级166项，其他101项。获得各类科技成果奖励104项，其中省部级科技奖30项，厅级卫生科技奖74项。申报专利39项，已获得国家发明专利19项、实用新型专利2项、软件著作权5项，并获得流行性出血热双价灭活疫苗等5项新药证书。（省疾控中心）
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