连锁药店再强大也必有其弱点，而单体药店应该努力寻找自己的优势所在，用自己的优势来对抗连锁药店的弱势，从而形成某种意义上的以强击弱格局，为自己的生存和发展争得一席之地。
第一，连锁药店实行规模经营，人员管理上相对集中，人人各司其职，固然可以使其经营有条不紊，但同时也会导致其经营方式不如单体药店灵活多样，所以单体药店完全可以利用这一点，在对消费者的服务上下一番工夫。比如，可以在条件允许的范围内推出免费诊疗、免费健康检查、免费煎制中药以及对那些行动不方便的老人、残疾人免费送药等等，博得消费者的信任和支持，从而赢得大批忠实顾客。
第二，连锁药店员工较多，完全是公司化管理，人情味较为淡薄，一般都是为业绩和任务而进行工作。而单体药店在某种意义上说更像是一个家庭，单体药店可以充分发挥人的优势，让员工们充分了解单体药店生存的艰难，从而使员工们团结一心，主动、积极地进行创造性的工作，并主动节省各项开支，从而实现真正意义上的开源节流。
第三，连锁药店的规模经营导致其在购药的选择上相对粗放和单一，其购进药品品种的改变也要经过较为繁琐的程序。而单体药店则可以“以细对粗”，在购药时多做考察，进行一些对比，因为不少常用药有很大的可替代性，单体药店完全可以在市场调研的基础上优化药品进货结构，增加价格低廉的药品，不断寻找更好的合作伙伴，保证常用药价稳定在居民可承受的合理价位，从而取得与连锁药店竞争的能力。
第四，单体药店可以结成联盟，共同应对连锁药店的冲击。单体药店如果只靠自己的努力是很难对抗连锁药店的，所以，单体药店应该联合起来，这样就可以取得较低的购药价格和较快的配送速度，同时也可以集思广益，收集较新的优秀药品品种为自己赢得较高的利润空间。
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