马晓伟说，从现实来看，我国医保的制度性建设培育了稳定且“购销两旺”的医疗服务市场，极大地推动了医疗服务体系的发展。医院必须下决心把计划经济时期遗留下来的摊子，逐步改变成适应社会主义市场机制、满足人民群众日益增长的多样化的医疗保健需求的发展模式，同时建立起一套现代管理制度，否则卫生事业发展给群众带来的好处就会被稀释，公立医疗机构就难以持续健康发展。
马晓伟指出，在几十年的发展过程中，公立医疗机构积累了一些需要解决的问题。如无序发展和不平衡发展，一些医院把扩张和创收作为主要目标，内部管理松弛导致的医疗质量和医疗安全问题等。相关部门对公立医院的监管还没有形成强有力的手段，卫生人才的培养也缺乏基本制度保证。另外，不合理的价格体系、政府投入的不足和不正当的药品营销手段等外部因素，也对医院发展产生消极影响。这些问题都到了非解决不可的时候了。
马晓伟强调，在接下来的公立医院改革当中，医院要消除顾虑，要清楚改革的总体原则是让医院能够健康有序发展，有利于医务人员技术水平和生活水平的提高，是为了限制医院的盲目扩张和不平衡发展，限制不合理的医疗费用增长，让人民群众切实感受到医改带来的好处。他要求，改革要进一步明确各方责任，政府层面主要解决规划和投入问题，卫生行政部门层面主要解决医疗服务监管、人才培养问题，医院层面主要解决内部管理、改善服务的问题。各部门要各负其责，共同推进改革。
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